樊昕昱现为上海交通大学电子工程系研究员，博士生导师，第四批“国家青年千人计划”入选者。2000年于上海交通大学应用物理系本科毕业，2003年上海交通大学应用物理系获硕士学位，2006年于日本东京大学电气工学专业获博士学位。2006年加入日本电信电话株式会社（NTT）研究所，任研究员，2011年升任研究主任。2012年归国，任上海交通大学研究员。研究方向为光纤传感、特种光纤、光纤器件与系统、光信息处理。
共发表学术论文100余篇。其中在IEEE Joual of Quantum Electronics、IEEE/OSA Joual of Lightwave Technology、OSA Optics Express、OSA Optics Letters等光电子学领域的国际一流学术期刊上发表论文18篇，在OFC、ECOC、CLEO等光纤通信与光电子学领域的顶级国际会议上发表论文26篇。共申报国际发明专利20余项，其中以第一发明人身份申报12项，目前已授权三项（均为第一发明人）。获日本电子信息学会（IEICE）学术奖（2011），NTT优秀论文奖（2008）和NTT研究开发奖（2011）。

现为美国电气和电子工程师协会（IEEE）及日本电子信息学会（IEICE）会员。长期担任IEEE Joual of Quantum Electronics、IEEE/OSA Joual of Lightwave Technology、IEEE Photonics Technology Letters、OSA Optics Express、OSA Optics Letters等光电子学领域的国际一流期刊审稿人。